Eclipse 3.1 の ASTParser は，それより前のバージョンとは仕様が異なり，Eclipse プラグインとしてしか動作しない。Eclipse 3.0 のものを利用すれば，問題なく standalone で動く。
Eclipse JDT には，Java のソースコードを構文解析する ASTParser というクラスがあって，これを使えばまぁ簡単に抽象構文木を得ることができたりします:
String source = "public class Foo {}";
ASTParser parser = ASTParser.newParser(AST.JLS3);
parser.setSource(source.toCharArray());
ASTNode ast = parser.createAST(null);
...
ASTParser については dW の記事 EclipseのASTParserを試す などが読みやすいです。さすが中の人。
で本題。なんか Eclipse を 3.1 にアップデートしたら standalone アプリからは利用できなくなっちゃったんですよ。ロードの段階でコケるようで，Eclipse プラグインとして動かさなきゃいけないようです。むむー。
ちょっと困りました。いや，Eclipse プラグインとして動かすこと自体はそれほど抵抗ないんですが（別でプラグインも作ってるし），なにが嫌かって，とにかく遅いんですよ。起動が。
standalone で動かないってことは，普通の JUnit テストが動きません。「JUnit プラグインテスト」を利用することになります。これは，Eclipse プラグインアーキテクチャに沿ってテストを起動するもので，まぁ乱暴な言い方をすればテストを起動するたびに Eclipse を立ち上げ直すようなもので，遅すぎて単体テストを放り投げたくなること請け合いな代物。
なんとかして Eclipse とは独立に動かしたい。とはいっても，3.0 にダウンするわけにはいきません。Eclipse 3.0 は J2SE 5.0 非対応。いまさら Generic の無い糞世界に戻ったら発狂しそうです（ただでさえ Java を使ってるとイライラするのに!）。
‥‥と，ここで気づいてしまいました。解析対象の Java コードは 1.4 相当じゃん。今書いている Java コードは 5.0 だけど，解析対象の Java コードまで 5.0 に対応させなくてもいいじゃん。てことは，JDT ライブラリ用に 3.0 を，IDE 用に 3.1 を用意しておいて，プロジェクトのビルドパスには 3.0 の JDT ライブラリを食わせればいいわけだ。至極単純，なんで今まで気づかなかったんだろうorz
というわけで，解析対象をダウングレードし:
ASTParser parser = ASTParser.newParser(AST.JLS2);
ビルドパスを適当にいじって解決。今度は Eclipse プラグインとして上がらなくなりそうですが，パスを動的にいろいろ弄くれば何とかなりそう。ふう。
ちなみに，Bugzilla のほうにも上がってるようです。3.2 のロードマップには噛んでなさそうだけど。
むー。Nightly 入れたら ASTParser のインターフェース変わってた。ぐぎぎぎ。追っかけるのヤメヤメ。
Eclipse 3.2 で修正されたようです。わーい